fasta

• fastpye cok benzeyen bir baska tool'dur, tek farki differential index yerine grafiksel dot plot yaratmasidir.
• sekizinci nesil yazarmis, hosgelmis.
• blastın kankası, aslında kalite bağlamında aynı seviyededir lakin, fasta daha yavaştır. ancak format konusunda bir tarz oluşturmuştur, fasta format çok kullanılan bir protein, nükleotid yazım standartıdır.
• nükleotid ya da protein dizilerinin tutulduğu dosya formatı.
  zamanında dizi hizalama için oluşturulan fasta (fast alignment) programının input formatı iken, günümüzde bioinformatikte standart haline gelmiştir. temel olarak 2 bölümden oluşmakta. ">" işareti ile başlayan ve ilgili dizi ile ilgili başlık, metadata yazılabilen "header" bölümü ve bu satırın altında bulunan sekans kısmı.
  örnek:
  >nc_000001.11 homo sapiens chromosome 1, grch38.p12
  gcaaccacctgagcgcgggcatcctgtgtgcagatactccctgcttcctctctagcccccac
  ctgcagagctggacccctgagctagccatgctctgacagtctcagttgcacacacgagccag
  caaggggttttgtgccacttctggatgctagggttacactgggagacacagcagtgaagct
  gaaataaaaatgtgttgctgtagtttgttattagaccccttctttccattggtttaattaggaa
  tggggaacccagagcctcacttgttcaggctccctctgccctagaagtgagaagtccagag
  
  başta scripting dilleri olmak üzere^****, bir çok dilde kolayca parse edebileceğiniz paketler bulunmakta.